MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium pasteurianum BC1 plasmid pCLOPA01

Total Repeats: 999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021183	TAT	2	6	451	456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827229
2	NC_021183	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827229
3	NC_021183	TAA	2	6	492	497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
4	NC_021183	TAGC	2	8	546	553	25 %	25 %	25 %	25 %	498827229
5	NC_021183	ATA	2	6	713	718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
6	NC_021183	A	6	6	841	846	100 %	0 %	0 %	0 %	498827229
7	NC_021183	A	6	6	911	916	100 %	0 %	0 %	0 %	498827229
8	NC_021183	AT	3	6	980	985	50 %	50 %	0 %	0 %	498827229
9	NC_021183	AAT	2	6	1003	1008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
10	NC_021183	AT	3	6	1044	1049	50 %	50 %	0 %	0 %	498827229
11	NC_021183	TTTTGA	2	12	1051	1062	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	498827229
12	NC_021183	ATA	2	6	1116	1121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
13	NC_021183	AGAA	2	8	1167	1174	75 %	0 %	25 %	0 %	498827229
14	NC_021183	AT	3	6	1177	1182	50 %	50 %	0 %	0 %	498827229
15	NC_021183	A	8	8	1234	1241	100 %	0 %	0 %	0 %	498827229
16	NC_021183	AAT	2	6	1373	1378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
17	NC_021183	AC	3	6	1388	1393	50 %	0 %	0 %	50 %	498827229
18	NC_021183	A	7	7	1437	1443	100 %	0 %	0 %	0 %	498827229
19	NC_021183	AGA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	498827229
20	NC_021183	GA	3	6	1482	1487	50 %	0 %	50 %	0 %	498827229
21	NC_021183	TCT	3	9	1983	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827230
22	NC_021183	AGC	2	6	1993	1998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	498827230
23	NC_021183	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827230
24	NC_021183	AT	3	6	2041	2046	50 %	50 %	0 %	0 %	498827230
25	NC_021183	GAA	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	498827230
26	NC_021183	TAT	2	6	2056	2061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827230
27	NC_021183	TCT	2	6	2067	2072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827230
28	NC_021183	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827230
29	NC_021183	CAA	2	6	2116	2121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	498827230
30	NC_021183	ATT	2	6	2141	2146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827230
31	NC_021183	T	6	6	2216	2221	0 %	100 %	0 %	0 %	498827230
32	NC_021183	TGC	2	6	2225	2230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	498827230
33	NC_021183	ATT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827230
34	NC_021183	CAT	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827230
35	NC_021183	ATGTAA	2	12	2266	2277	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	498827230
36	NC_021183	T	7	7	2330	2336	0 %	100 %	0 %	0 %	498827231
37	NC_021183	TAAA	2	8	2347	2354	75 %	25 %	0 %	0 %	498827231
38	NC_021183	AGT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827231
39	NC_021183	TGT	2	6	2430	2435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	498827231
40	NC_021183	ACC	2	6	2441	2446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	498827231
41	NC_021183	TCA	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
42	NC_021183	CTTT	2	8	2533	2540	0 %	75 %	0 %	25 %	498827231
43	NC_021183	AT	3	6	2541	2546	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
44	NC_021183	T	6	6	2564	2569	0 %	100 %	0 %	0 %	498827231
45	NC_021183	CTT	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827231
46	NC_021183	AACATT	2	12	2612	2623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	498827231
47	NC_021183	TCC	2	6	2771	2776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	498827231
48	NC_021183	T	6	6	2795	2800	0 %	100 %	0 %	0 %	498827231
49	NC_021183	TTCAAA	2	12	2870	2881	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	498827231
50	NC_021183	ATC	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
51	NC_021183	ATTT	2	8	2897	2904	25 %	75 %	0 %	0 %	498827231
52	NC_021183	TAA	2	6	2923	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827231
53	NC_021183	TTCT	3	12	3090	3101	0 %	75 %	0 %	25 %	498827231
54	NC_021183	AT	3	6	3120	3125	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
55	NC_021183	TCA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
56	NC_021183	TAC	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
57	NC_021183	ATC	2	6	3155	3160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
58	NC_021183	AT	3	6	3174	3179	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
59	NC_021183	A	6	6	3207	3212	100 %	0 %	0 %	0 %	498827231
60	NC_021183	ATT	2	6	3242	3247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827231
61	NC_021183	TAC	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
62	NC_021183	AT	3	6	3315	3320	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
63	NC_021183	AATT	2	8	3604	3611	50 %	50 %	0 %	0 %	498827232
64	NC_021183	A	6	6	3617	3622	100 %	0 %	0 %	0 %	498827232
65	NC_021183	AAATA	2	10	3636	3645	80 %	20 %	0 %	0 %	498827232
66	NC_021183	TA	3	6	3644	3649	50 %	50 %	0 %	0 %	498827232
67	NC_021183	ATC	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827232
68	NC_021183	TAA	2	6	3679	3684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827232
69	NC_021183	TAA	2	6	3733	3738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827232
70	NC_021183	ATA	3	9	3789	3797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827232
71	NC_021183	CTA	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827232
72	NC_021183	AGAAAA	2	12	3904	3915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	498827232
73	NC_021183	ACA	3	9	3941	3949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	498827232
74	NC_021183	TAAAGA	2	12	4048	4059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	498827232
75	NC_021183	AGA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	498827232
76	NC_021183	TA	3	6	4188	4193	50 %	50 %	0 %	0 %	498827232
77	NC_021183	A	6	6	4193	4198	100 %	0 %	0 %	0 %	498827232
78	NC_021183	A	7	7	4225	4231	100 %	0 %	0 %	0 %	498827232
79	NC_021183	A	6	6	4283	4288	100 %	0 %	0 %	0 %	498827232
80	NC_021183	ATA	2	6	4297	4302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827232
81	NC_021183	TAG	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827233
82	NC_021183	GTA	2	6	4507	4512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827233
83	NC_021183	A	6	6	4564	4569	100 %	0 %	0 %	0 %	498827233
84	NC_021183	TAT	2	6	4570	4575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827233
85	NC_021183	GCG	2	6	5009	5014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	498827234
86	NC_021183	CTT	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
87	NC_021183	A	6	6	5062	5067	100 %	0 %	0 %	0 %	498827234
88	NC_021183	TCCG	2	8	5094	5101	0 %	25 %	25 %	50 %	498827234
89	NC_021183	TA	3	6	5118	5123	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
90	NC_021183	TTA	2	6	5127	5132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827234
91	NC_021183	ATT	2	6	5143	5148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827234
92	NC_021183	TTC	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
93	NC_021183	CTT	3	9	5230	5238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
94	NC_021183	T	6	6	5237	5242	0 %	100 %	0 %	0 %	498827234
95	NC_021183	AT	3	6	5352	5357	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
96	NC_021183	TTTGT	2	10	5424	5433	0 %	80 %	20 %	0 %	498827234
97	NC_021183	AT	3	6	5439	5444	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
98	NC_021183	AT	3	6	5451	5456	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
99	NC_021183	CTTT	2	8	5514	5521	0 %	75 %	0 %	25 %	498827234
100	NC_021183	CTTTC	2	10	5544	5553	0 %	60 %	0 %	40 %	498827234
101	NC_021183	TTC	2	6	5610	5615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
102	NC_021183	CAA	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	498827234
103	NC_021183	CTT	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
104	NC_021183	CATTT	2	10	5656	5665	20 %	60 %	0 %	20 %	498827234
105	NC_021183	CATTTT	2	12	5736	5747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	498827234
106	NC_021183	T	6	6	5744	5749	0 %	100 %	0 %	0 %	498827234
107	NC_021183	T	6	6	5794	5799	0 %	100 %	0 %	0 %	498827234
108	NC_021183	TTTTA	2	10	5878	5887	20 %	80 %	0 %	0 %	498827234
109	NC_021183	TCC	2	6	5998	6003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	498827234
110	NC_021183	TA	3	6	6024	6029	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
111	NC_021183	CTT	2	6	6147	6152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
112	NC_021183	GCT	2	6	6199	6204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	498827234
113	NC_021183	TGT	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	498827234
114	NC_021183	ATAA	2	8	6288	6295	75 %	25 %	0 %	0 %	498827234
115	NC_021183	TCT	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
116	NC_021183	CAAATA	2	12	6855	6866	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	498827235
117	NC_021183	AAG	2	6	6877	6882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	498827235
118	NC_021183	AT	3	6	6899	6904	50 %	50 %	0 %	0 %	498827235
119	NC_021183	ATA	2	6	6927	6932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827235
120	NC_021183	AT	3	6	6953	6958	50 %	50 %	0 %	0 %	498827235
121	NC_021183	ATT	2	6	6963	6968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827235
122	NC_021183	A	7	7	6990	6996	100 %	0 %	0 %	0 %	498827235
123	NC_021183	TAT	2	6	7002	7007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827235
124	NC_021183	TAA	2	6	7035	7040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827235
125	NC_021183	CA	3	6	7097	7102	50 %	0 %	0 %	50 %	498827235
126	NC_021183	ATA	2	6	7185	7190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827235
127	NC_021183	ATG	2	6	7212	7217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827235
128	NC_021183	TG	3	6	7216	7221	0 %	50 %	50 %	0 %	498827235
129	NC_021183	ATT	2	6	7274	7279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827235
130	NC_021183	ATG	2	6	7302	7307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827235
131	NC_021183	TTG	2	6	7323	7328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	498827235
132	NC_021183	TGA	2	6	7366	7371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827235
133	NC_021183	ATT	2	6	7384	7389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827235
134	NC_021183	GTG	2	6	7399	7404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	498827235
135	NC_021183	A	6	6	7419	7424	100 %	0 %	0 %	0 %	498827235
136	NC_021183	TCAG	2	8	7447	7454	25 %	25 %	25 %	25 %	498827235
137	NC_021183	CAT	2	6	8316	8321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827236
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139	NC_021183	CCAT	2	8	8389	8396	25 %	25 %	0 %	50 %	498827236
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142	NC_021183	ATA	2	6	8550	8555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827236
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262	NC_021183	T	6	6	16701	16706	0 %	100 %	0 %	0 %	498827241
263	NC_021183	T	6	6	16757	16762	0 %	100 %	0 %	0 %	498827241
264	NC_021183	AT	3	6	16972	16977	50 %	50 %	0 %	0 %	498827242
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